Mark Harmon verdient 525.000 US-Dollar plus einen Gewinnanteil für seine Hauptrolle in NCIS. Pauley Perrette und Michael Weatherly verdienen 175.000 US-Dollar pro Folge für ihre Rollen in der Serie.
Mark Harmons Vertrag wurde auf den aktuellen Stand gebracht, als NCIS 2013 um eine 11. Staffel verlängert wurde. Harmons Gehalt machte ihn zum bestbezahlten Dramaschauspieler im Fernsehen zum Zeitpunkt seiner Verpflichtung hinter Ashton Kutcher und Jon Cryer für ihre Rollen in Two and a Half Men. Harmon wurde 2015 zum bestbezahlten Schauspieler im Fernsehen, als „Two and a Half Men“ seine 12-Staffeln-Serie abschloss. Zusätzlich zu seinem Schauspielgehalt erhält Harmon Restzahlungen als ausführender Produzent von NCIS.