Zu Athenas Verbündeten gehörten viele Helden der griechischen Mythologie, darunter Odysseus, Jason Perseus und Herakles. Da sie sich im Trojanischen Krieg auf die Seite der Griechen stellte, gehörten Paris und die anderen Verteidiger Trojas zu ihren Feinden. Zu ihren Gegnern zählten Hephaistos und Poseidon.
Der griechischen Mythologie zufolge half Athene Jason, das Goldene Vlies zu erlangen. Sie half Perseus auch bei der Enthauptung von Medusa. Sie riet Herakles, mit den Klauen des Löwen von Nemea dessen uneinnehmbare Haut zu durchschneiden, gab ihm eine Rassel, um die stymphalischen Vögel zu erschrecken, damit er sie töten konnte, und half ihm, in die Unterwelt vorzudringen, um Cerberus zu besiegen. Athene bot Odysseus während des Trojanischen Krieges Rat an, beschützte ihn auf seinen Wanderungen, führte ihn nach Hause und half ihm, seine Heimat und seine Frau wiederzugewinnen.
Ein griechischer Mythos besagt, dass Aphrodite Hera und Athene alle behaupteten, die schönste Göttin zu sein, und Zeus ernannte Paris zum trojanischen Prinzen, um zwischen ihnen zu entscheiden. Paris entschied sich für Aphrodite gegenüber Athene und dies veranlasste Athene, im Trojanischen Krieg die griechische Seite zu bevorzugen. Obwohl sowohl Ares als auch Athene Vertreter des Krieges waren, symbolisierte sie eher Weisheit, Einsicht, Mut, Ruhm und moralische Überlegenheit als Angst und Blutdurst. Obwohl Athene als jungfräuliche Göttin gilt, wurde sie Mutter. Hephaistos, der Sohn von Zeus und Hera, versuchte, sie zu vergewaltigen, und als sein Samen von ihrem Bein auf die Erde fiel, wurde der halb Schlange, halb Mensch Erichthonius geboren. Poseidon wurde Athenas Gegner aufgrund eines Streits darüber, wer der Schutzpatron Athens sein sollte. In ihrem Wettbewerb boten sie den Athenern jeweils Geschenke an. Poseidon bot den Athenern einen Salzwasserbrunnen an, doch Athene gewann, indem sie ihnen einen Olivenbaum schenkte.